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一種結(jié)合隨機(jī)森林和Relief F的全基因組SNP位點(diǎn)分析方法

18712020/06/16
基本信息
  • 成果類型 高等院校
  • 委托機(jī)構(gòu) 西安電子科技大學(xué)
  • 成果持有方 西安電子科技大學(xué)
  • 行業(yè)領(lǐng)域 計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)
  • 項(xiàng)目名稱 一種結(jié)合隨機(jī)森林和Relief F的全基因組SNP位點(diǎn)分析方法
  • 知識(shí)產(chǎn)權(quán) 發(fā)明專利
  • 項(xiàng)目簡(jiǎn)介 本發(fā)明公開(kāi)了一種結(jié)合隨機(jī)森林和Relief?F的全基因組SNP位點(diǎn)分析方法,首先應(yīng)用廣義線性模型對(duì)SNP位點(diǎn)進(jìn)行初步篩選,接著利用Relief?F處理SNP交互作用的能力,預(yù)先將存在交互作用的SNP位點(diǎn)排到隊(duì)列前面,然后將隊(duì)列后面的SNP位點(diǎn)利用隨機(jī)森林進(jìn)行排名,以識(shí)別單個(gè)SNP位點(diǎn)的邊緣作用,這樣得到一個(gè)SNP的排名隊(duì)列,去掉排在隊(duì)列末端的SNP位點(diǎn)之后,重新應(yīng)用Relief?F和隨機(jī)森林進(jìn)行處理,如此迭代,最后得到SNP位點(diǎn)的排序結(jié)果。本發(fā)明綜合考慮單個(gè)SNP位點(diǎn)的作用和位點(diǎn)之間的交互作用,能處理全基因組SNP數(shù)據(jù),進(jìn)而發(fā)現(xiàn)與復(fù)雜疾病相關(guān)的SNP位點(diǎn),對(duì)復(fù)雜疾病的致病機(jī)理研究、疾病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)和生物藥物研制等都有重要的意義。
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交易信息
  • 意向交易額 面議
  • 掛牌時(shí)間 2021/06/16
  • 委托機(jī)構(gòu) 西安電子科技大學(xué)
  • 聯(lián)系人姓名 王小剛
  • 聯(lián)系人電話 15802954800
  • 聯(lián)系人郵箱 745490733@qq.com
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